之前提到蔣經國在上任後三個月推出《加速農村建設重要措施》，這個政策共計有九大措施，其中一樣就是廢除肥料換穀制度，而這個措施的提議人，就是剛升任政務委員，被號稱最年輕的閣員的李登輝。
廢除肥料換穀制度也成為人民提到李登輝在農業上的貢獻中，最津津樂道的一樣，也因為當初推動農業改革的成功，他在1978年改派台北市長。
肥料換穀政策到底對農民產生什麼影響？民國39年正式推動了肥料換穀制度，當初的化學肥料是政府的獨佔事業，你想要取得肥料只能跟政府買，1949年政府剛推動的時候1公斤的稻穀只能換1.5公斤的硫銨，官規的兌換比例還越來越低，後來還1公斤稻穀只能換1.18公斤的硫銨。
但實際上化肥當然不值這些稻穀的錢，而且還產生了定錨效應使糧價壓低，造成對於稻農的剝削，也埋下了日後相關農業福利補償的遠因。
那個年代還沒有公糧收購制度，肥料換穀就成為政府取得稻米的方式之一，政府取得便宜的稻米之後，再外銷換取外匯。
蔣經國上任之後在李登輝的建議之下就廢除了肥料換穀制度，政府儲備的糧食當然就下降了，肥料換穀廢除一年後，1973年就發生了石油危機，發生了台灣稻米存量不足，需要緊急跟泰國進口的情況。
當初就有人提出恢復肥料換穀的制度，但蔣經國覺得這種制度是對農民不好的制度，不能恢復這種制度，但是國家又有稻米的儲備需求怎麼辦？
所以在1974年提撥30億成立糧食平準基金，開始辦理稻穀報價收購，而過去因為肥料換穀剝削農民，因此稻穀保價收購就要嚷農民獲利，因此規定收購價為生產成本加2成利潤，而且是無限量收購，保證農民種稻穩賺錢，一推出之後大受好評，深得稻農支持，公糧收購量從1974年18.7萬噸，經過兩年1976年達到72.9萬噸，三年成長4倍。
無限量高價收購的結果導致公糧過多、政府補貼過多，所以1977年馬上大調整改成一公頃970公斤的計劃收購，當然造成農民大反彈，1978年只好增加輔導收購，1期作850公斤，2期作500公斤，稻米收購政策從此定型，將近20年的時間沒有更改。
即使是李登輝執政之後，也沒有農業大量社會福利化的問題，他任內的老農津貼一年也只有40多億的支出，但後面繼任者不斷的加碼才造成今天的慘況，他沒有虧對一個專業的農經學者的身分。
但他卸任之後，從2003年開始，每四年都隨著選舉調漲一次，導致公糧爆倉，政府支出上百億辦理相關業務，過去20年的時間農委會相關福利補貼的預算跟比例越來越高。
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